| はじめに iii |
| 第1章 Rの準備 1 |
| 1.1 Rのインストール 2 |
| 1.2 Rの基本操作 2 |
| 1.2.1 Rの起動と終了 2 |
| 1.2.2 Rの関数 5 |
| 1.2.3 ベクトルの演算 6 |
| 1.2.4 行列の演算 8 |
| 1.2.5 ファイル入出力 13 |
| 1.2.6 統計関係の関数 16 |
| 1.2.7 パッケージ 19 |
| 1.3 Rプログラミングの基礎 22 |
| 1.3.1 条件分岐と繰り返し 22 |
| 1.3.2 繰り返しの制御 25 |
| 1.3.3 関数の書き方 26 |
| 1.3.4 任意の引数とデフォルトの値 28 |
| 1.3.5 ファイルのロード 29 |
| 1.3.6 バッチ処理 30 |
| 第2章 クラスタリング入門 33 |
| 2.1 クラスタリングとは 34 |
| 2.2 クラスタリング手法の概要 35 |
| 2.3 クラスタリング結果の評価 37 |
| 2.3.1 クロス表 37 |
| 2.3.2 エントロピー（entropy） 38 |
| 2.3.3 純度（purity） 39 |
| 2.3.4 F尺度（F-measure） 40 |
| 2.3.5 精度（accuracy） 41 |
| 2.4 Rのプログラミングメモ 42 |
| 2.4.1 関数apply( ) 42 |
| 2.4.2 関数rowSums( )とcolSums( ) 43 |
| 2.4.3 無名関数 44 |
| 第3章 クラスタリングの準備 45 |
| 3.1 データのベクトル化 46 |
| 3.2 データ間の（非）類似度 48 |
| 3.3 本書で扱うデータセット 49 |
| 3.4 スパース行列の扱い 52 |
| 3.5 Rのプログラミングメモ 54 |
| 3.5.1 対角行列 54 |
| 3.5.2 ワンズベクトル 57 |
| 第4章 階層的手法 61 |
| 4.1 アルゴリズムと数値例 62 |
| 4.2 デンドログラム 70 |
| 4.3 Rによる解析 72 |
| 4.4 Rのプログラミングメモ 76 |
| 4.4.1 転置行列 76 |
| 4.4.2 関数as.～( ) 78 |
| 第5章 k-means 81 |
| 5.1 アルゴリズム 82 |
| 5.2 数値例 83 |
| 5.3 Rによる解析 88 |
| 5.4 Rのプログラミングメモ 92 |
| 5.4.1 関数sample( ) 92 |
| 5.4.2 関数duplicated( ) 93 |
| 5.4.3 並行して処理できる繰り返し 94 |
| 第6章 混合分布モデル 97 |
| 6.1 確率モデルによるクラスタリング 98 |
| 6.2 EMアルゴリズム 102 |
| 6.3 数値例 109 |
| 6.4 Rによる解析 113 |
| 6.5 Rのプログラミングメモ 117 |
| 6.5.1 関数which.max( )とwhich.min( ) 117 |
| 6.5.2 ベクトルのインデックスの取り出し 117 |
| 6.5.3 グラフの作成 118 |
| 第7章 スペクトラルクラスタリング 121 |
| 7.1 グラフ分割としてのクラスタリング 122 |
| 7.1.1 MCut 123 |
| 7.1.2 Ncut 127 |
| 7.2 数値例 129 |
| 7.3 Rによる解析 132 |
| 7.4 Rのプログラミングメモ 135 |
| 7.4.1 関数order( ) 135 |
| 7.4.2 行列の一部は行列 135 |
| 7.4.3 関数eigen( ) 137 |
| 第8章 次元縮約 139 |
| 8.1 高次元データから低次元データへ 140 |
| 8.1.1 特異値分解 140 |
| 8.1.2 LSI 142 |
| 8.1.3 pLSI 142 |
| 8.1.4 NMF 147 |
| 8.2 数値例 152 |
| 8.2.1 特異値分解 152 |
| 8.2.2 pLSI 154 |
| 8.2.3 NMF 157 |
| 8.3 Rによる解析 160 |
| 8.3.1 特異値分解 160 |
| 8.3.2 pLSI 161 |
| 8.3.3 NMF 164 |
| 8.4 Rのプログラミングメモ 166 |
| 8.4.1 複数の返り値 166 |
| 8.4.2 3次元配列 166 |
| 8.4.3 関数paste( ) 167 |
| 第9章 ファジィクラスタリング 169 |
| 9.1 アルゴリズム 170 |
| 9.2 数値例 173 |
| 9.3 Rによる解析 178 |
| 9.4 Rのプログラミングメモ 181 |
| 9.4.1 デバッグ 181 |
| 9.4.2 ソースの確認 183 |
| 9.4.3 関数help( ) 185 |
| 付録 式の証明 187 |
| A.1 式（6.4）の証明 188 |
| A.2 式（6.5）の証明 189 |
| A.3 式（7.4）の証明 192 |
| A.4 式（7.5）の証明 192 |
| A.5 式（7.6）の証明 193 |
| A.6 式（7.7）の証明 194 |
| A.7 式（8.5）について 195 |
| A.8 式（8.11）の証明 196 |
| A.9 式（8.12）の証明 198 |
| A.10 式（8.13）について 199 |
| A.11 式（8.14）について 200 |
| 参考文献 201 |
| 索引 205 |
