| 1.元素，原子，電子 1 |
| 1.1 同位体 2 |
| 1.2 電子 3 |
| 1.3 まとめ 8 |
| 1.4 自己診断テスト 9 |
| 1.5 発展：同位体と生物学 9 |
| 1.6 発展：周期表 13 |
| 2.結合，電子，分子 19 |
| 2.1 共有結合とは？ 19 |
| 2.2 非結合電子：孤立電子対 21 |
| 2.3 π分子軌道 22 |
| 2.4 配位結合 23 |
| 2.5 電気陰性度と共有結合の極性 24 |
| 2.6 電気陰性度は共有結合にどのような影響を与えるか 25 |
| 2.7 イオン結合 26 |
| 2.8 化学結合の概念 26 |
| 2.9 まとめ 27 |
| 2.10 自己診断テスト 28 |
| 2.11 発展：ペプチド結合 28 |
| 3.分子間相互作用 34 |
| 3.1 水素結合 34 |
| 3.2 電荷－電荷相互作用 37 |
| 3.3 近距離の電荷－電荷相互作用 38 |
| 3.4 疎水性相互作用 39 |
| 3.5 まとめ 40 |
| 3.6 自己診断テスト 40 |
| 3.7 発展：水への溶解度 41 |
| 4.分子の数の表し方 46 |
| 4.1 モル：物質量の単位 46 |
| 4.2 モル質量 48 |
| 4.3 モルとモル濃度 49 |
| 4.4 単位についてのメモ 50 |
| 4.5 希釈 51 |
| 4.6 パーセント組成の溶液 52 |
| 4.7 まとめ 53 |
| 4.8 自己診断テスト 54 |
| 4.9 発展：モルに慣れる 55 |
| 5.炭素－生命体のもと 59 |
| 5.1 炭素の電子配置 59 |
| 5.2 混成 60 |
| 5.3 炭素が四価であること 61 |
| 5.4 分子の形 62 |
| 5.5 π結合と電子の非局在化 64 |
| 5.6 芳香族性 66 |
| 5.7 まとめ 67 |
| 5.8 自己診断テスト 67 |
| 5.9 発展：多様な炭素構造体 68 |
| 6.形だけが異なる同じ分子 72 |
| 6.1 異性体 72 |
| 6.2 光学異性 72 |
| 6.3 幾何異性 76 |
| 6.4 立体異性体が問題になる場合 78 |
| 6.5 まとめ 79 |
| 6.6 自己診断テスト 80 |
| 7.水－生命の溶媒 81 |
| 7.1 水分子の結合 81 |
| 7.2 水の解離（自己イオン化） 82 |
| 7.3 酸と塩基 84 |
| 7.4 酸性度とpH 85 |
| 7.5 水のpHの計算 86 |
| 7.6 水中での弱酸と弱塩基の解離 87 |
| 7.7 緩衝液 89 |
| 7.8 へンダーソン－ハッセルバルヒの式を用いた緩衝系のpHの計算 90 |
| 7.9 生命と水 91 |
| 7.10 アミノ酸 93 |
| 7.11 細胞のpHの調節 94 |
| 7.12 まとめ 95 |
| 7.13 自己診断テスト 96 |
| 7.14 発展：生体の緩衝液 96 |
| 8.反応する分子とエネルギー 101 |
| 8.1 分子からエネルギーを得る 101 |
| 8.2 分子を反応させるには？ 103 |
| 8.3 エネルギー，熱，仕事：熱力学の基礎用語 105 |
| 8.4 エンタルピー 106 |
| 8.5 エントロピー 107 |
| 8.6 ギブズ自由エネルギーと仕事 107 |
| 8.7 生物反応でのエネルギー変化 110 |
| 8.8 まとめ 111 |
| 8.9 自己診断テスト 112 |
| 8.10 発展：自由エネルギーと代謝経路 113 |
| 9.反応中の分子と反応速度論 120 |
| 9.1 速度式 121 |
| 9.2 反応の経路と反応機構 123 |
| 9.3 律速段階 124 |
| 9.4 活性化エネルギーを考える 124 |
| 9.5 平衡 125 |
| 9.6 平衡点は変わりうる 127 |
| 9.7 自由エネルギーと平衡 129 |
| 9.8 平衡では，自由エネルギー変化はゼロである 129 |
| 9.9 まとめ 130 |
| 9.10 自己診断テスト 131 |
| 10.エネルギーと生命 132 |
| 10.1 酸化と還元 133 |
| 10.2 半反応 134 |
| 10.3 酸化還元電位 136 |
| 10.4 自由エネルギーと酸化還元電位 138 |
| 10.5 生命のエネルギーを獲得するには？ 138 |
| 10.6 自由エネルギーに何が起こっているのか 140 |
| 10.7 まとめ 141 |
| 10.8 自己診断テスト 141 |
| 10.9 発展：酸化 142 |
| 11.生体分子の反応性 145 |
| 11.1 付加反応 146 |
| 11.2 置換反応 147 |
| 11.3 脱離反応 147 |
| 11.4 ラジカル反応 148 |
| 11.5 π結合と付加反応 149 |
| 11.6 官能基が分子を連結していく 151 |
| 11.7 酵素触媒反応 154 |
| 11.8 まとめ 155 |
| 11.9 自己診断テスト 155 |
| 11.10 発展：酵素触媒 156 |
| 自己診断テストの解答 162 |
| 付録 |
| 1. よく知られている化合物の化学式，名称，性状 168 |
| 2. よく知られているアニオンとカチオン 169 |
| 3. よく知られている官能基 169 |
| 4. 表記法，公式，定数 170 |
| 5. 用語解説 175 |
| 索引 185 |
