1 生命を化学する 1 |
1.1 生命と化学 1 |
1.2 ナノとバイオの融合 2 |
1.3 これまでの生命化学 3 |
1.4 これからの生命化学 4 |
2 細胞内の化学反応 9 |
2.1 生命分子の特徴 10 |
2.2 細胞小器官 12 |
2.3 水の諸性質と水溶液中の分子 14 |
2.4 水の電離とpH 16 |
2.5 電解質の電離 17 |
2.6 酸と塩某 17 |
3 熱力学と反応速度 19 |
3.1 生体反応と熱力学 20 |
3.2 反応が自発的に進行するかどうかの指標―自由エネルギー変化 20 |
3.3 結合反応の熱力学 23 |
3.4 プロトン移動反応の熱力学 24 |
3.5 酸化還元反応の熱力学 24 |
3.6 生命分子の相互作用とエネルギー 25 |
3.7 不可逆反応の速度論 29 |
3.8 可逆反応の速度論 31 |
4 核酸とヌクレオチド 33 |
4.1 ヌクレオシドとヌクレオチド 34 |
4.2 ワトソン―クリック塩基対 36 |
4.3 二重らせん構造 38 |
4.4 非塩基対部位 38 |
4.5 らせん構造の多様性 41 |
4.6 核酸の高次構造 42 |
4.7 水とカチオンの結合 44 |
5 核酸の安定性 49 |
5.1 核酸構造の安定性 49 |
5.2 構造安定化因子 51 |
5.3 核酸の光吸収特性 52 |
5.4 熱力学的パラメーターの算出法 54 |
5.5 カチオンの結合 56 |
6 タンパク質とアミノ酸 59 |
6.1 アミノ酸とペプチド 59 |
6.2 タンパク質の二次構造 62 |
6.3 タンパク質の高次構造 66 |
6.4 タンパク質のフォールディングの熱力学 68 |
6.5 タンパク質とヌクレオチドの相互作用 69 |
7 酵素 73 |
7.1 酵素の役割と分類 73 |
7.2 酵素の触媒機構 76 |
7.3 反応速度の温度依存性と遷移状態理論 77 |
7.4 ミカエリス―メンテン型の反応機構 79 |
7.5 酵素活性の変化 80 |
7.6 リボザイム(RNA酵素) 82 |
8 遺伝情報の流れ 85 |
8.1 DNA複製 86 |
8.2 末端複製問題 88 |
8.3 DNAの修復 89 |
8.4 DNAからRNAへの遺伝情報の転写 93 |
8.5 RNAの転写後修飾 93 |
8.6 タンパク質への翻訳 94 |
9 細胞のダイナミクス 99 |
9.1 原核生物と真核生物の遺伝子発現調節機構 100 |
9.2 物質の輸送と細胞膜を介した物質移動 102 |
9.3 細胞増殖と細胞周期―リン酸化/脱リン酸化反応 106 |
9.4 がん遺伝子とがん抑制遺伝子 109 |
10 糖 113 |
10.1 単糖 114 |
10.2 オリゴ糖類・多糖類 117 |
10.3 グリコサミノグリカン 120 |
10.4 糖タンパク質 122 |
11 脂質と生体膜 125 |
11.1 脂肪酸の分類 125 |
11.2 脂質の分類 127 |
11.3 生体膜を形成する脂質 129 |
11.4 膜タンパク質とリポタンパク質 131 |
11.5 膜輸送 132 |
12 生体のエネルギー産生 137 |
12.1 エネルギー貯蔵物質ATP 138 |
12.2 酸化還元酵素とその補酵素 139 |
12.3 グルコースの分解―解糖とアルコール発酵 140 |
12.4 TCAサイクルの反応 144 |
12.5 電子伝達の媒体となる化合物 140 |
12.6 電子伝達の経路 149 |
12.7 酸化的リン酸化の機構 151 |
12.8 好気的解糖系のエネルギー収支 153 |
12.9 脂質(脂肪酸)の分解反応 154 |
12.10 飽和脂肪酸の分解に伴うエネルギー収支 156 |
13 バイオテクノロジー 159 |
13.1 PCR法 160 |
13.2 モレキュラービーコン法 161 |
13.3 金ナノ微粒子プローブ法 163 |
13.4 DNAチップ 164 |
13.5 アンチセンス法 165 |
13.6 ドラッグデリバリー 167 |
13.7 デオキシリボザイム(DNAZyme) 168 |
13.8 RNA干渉 168 |
13.9 リボスイッチ 170 |
14 ナノバイオマテリアル 171 |
14.1 コンビナトリアルケミストリー法 172 |
14.2 核酸結合性分子 175 |
14.3 ナノ構造体の構築 175 |
14.4 細胞内センシング 177 |
14.5 核内への人工分子の導入 178 |
14.6 ペプチドによるタンパク質機能の制御 179 |
14.7 モレキュラーインプリンティング法 181 |
14.8 発展するナノバイオ 182 |
索引 185 |