| 第1部 構造生物学の基礎 |
| 第1章 生物学から構造生物学へ－生物学と構造化学の融合 3 |
| 1.1 構造生物学の重要性とその応用 3 |
| 1.2 生命－細胞，核酸，タンパク質 5 |
| 1.3 遺伝子からタンパク質へ－セントラルドグマ 5 |
| 1.4 タンパク質の分類 7 |
| 1.5 細胞内のタンパク質－適所，適量，適時の調節 9 |
| 第2章 機能性生体高分子（核酸やタンパク質）ができるまで－小分子から生体高分子へ 11 |
| 2.1 核酸・タンパク質の基本構造 11 |
| 2.1.1 核酸の構成単位－糖，塩基，リン酸 11 |
| 2.1.2 核酸（DNA）の高次構造 12 |
| 2.1.3 タンパク質の構成単位－アミノ酸 17 |
| 2.1.4 アミノ酸から一次構造へ－ペプチド結合 22 |
| 2.1.5 一次構造から二次構造へ 25 |
| 2.1.6 二次構造から三次構造へ 36 |
| 2.1.7 三次構造から四次構造へ 36 |
| 2.2 立体構造構築原理 42 |
| 2.2.1 構造安定化因子－さまざまな相互作用 42 |
| 2.2.2 一次構造から立体（三次）構造へ－タンパク質のフォールディング 49 |
| 2.2.3 構造の柔軟性 52 |
| 2.3 タンパク質の立体構造がもつ特徴のまとめ 53 |
| 第2部 細胞における機能分子の構造生物学 |
| 第3章 遺伝情報の発現－転写や翻訳にかかわるタンパク質や核酸 57 |
| 3.1 転写システム 58 |
| 3.1.1 HTHモチーフによる転写制御 59 |
| 3.1.2 Znフィンガーモチーフによる転写制御 65 |
| 3.1.3 他のモチーフによる転写制御 68 |
| 3.1.4 転写開始 70 |
| 3.2 翻訳システム－リボソーム 71 |
| 第4章 エネルギーの獲得－生命活動に必要なエネルギー生成にかかわるタンパク質 78 |
| 4.1 光合成にかかわるタンパク質 78 |
| 4.2 細胞呼吸にかかわるタンパク質 84 |
| 4.2.1 シトクロムc酸化酵素 85 |
| 4.2.2 ATP合成酵素 87 |
| 4.3 電子伝達タンパク質 89 |
| 4.3.1 c型シトクロム 89 |
| 4.3.2 鉄－硫黄クラスタータンパク質 92 |
| 第5章 物質輸送 96 |
| 5.1 トランスポーターとポンプタンパク質 97 |
| 5.1.1 カルシウムATPase（Ca2+-ATPase） 97 |
| 5.1.2 核内外への輸送－インポーチン，エクスポーチン 102 |
| 5.1.3 バクテリオロドプシン 104 |
| 5.2 小分子輸送タンパク質－ヘモグロビン，ミオグロビン 107 |
| 5.2.1 生理的性質 108 |
| 5.2.2 ミオグロビンとヘモグロビンの構造 109 |
| 5.2.3 オキシ型とデオキシ型の四次構造変化 110 |
| 5.2.4 グロビンフォールドタンパク質の進化 114 |
| 第6章 情報（シグナル）伝達 117 |
| 6.1 細胞表面の受容体（レセプター） 118 |
| 6.1.1 イオンチャネル連結型レセプター 118 |
| 6.1.2 酵素連結型レセプター 119+ |
| 6.1.3 Gタンパク質共役型レセプター 119 |
| 6.2 細胞内シグナル伝達分子 121 |
| 6.2.1 GTP結合タンパク質（Gタンパク質） 122 |
| 6.2.2 プロティンキナーゼ 126 |
| 6.2.3 標的タンパク質 130 |
| 6.2.4 ヌクレオチド結合性調節タンパク質の進化 141 |
| 6.2.5 カリウムチャネルと水チャネル分子 143 |
| 第7章 代謝 147 |
| 7.1 酵素反応 148 |
| 7.2 加水分解酵素－セリンプロテアーゼ 152 |
| 7.2.1 活性部位の構造の特徴 153 |
| 7.2.2 反応機構 155 |
| 7.2.3 他の加水分解酵素 157 |
| 7.3 酸化還元酵素－乳酸脱水素酵素 160 |
| 7.4 ラジカル酵素 162 |
| 7.5 酵素に見られる立体特異性 163 |
| 7.6 酵素の分子進化 165 |
| 7.7 分子シャペロン－シャペロニン : GroEL・GroES複合体 170 |
| 第8章 免疫 174 |
| 8.1 抗体－IgG 176 |
| 8.1.1 全体構造 176 |
| 8.1.2 抗原結合部位 178 |
| 8.2 MHCとT細胞受容体 180 |
| 8.2.1 MHCの構造 180 |
| 8.2.2 MHC分子とペプチドの結合 181 |
| 8.2.3 T細胞受容体・ペプチド・MHC複合体の構造 183 |
| 第9章 骨格（構造）形成 185 |
| 9.1 コラーゲン 186 |
| 9.2 ウイルスの外殻（キャプシド） 190 |
| コラム : 発光タンパク質と蛍光タンパク質 192 |
| 第10章 基本構造のまとめ 195 |
| 10.1 αドメインタンパク質 195 |
| 10.1.1 4本αヘリックスバンドル構造 195 |
| 10.1.2 グロビンフォールド 197 |
| 10.2 βドメインタンパク質 201 |
| 10.2.1 βバレル 201 |
| 10.2.2 βサンドイッチ 203 |
| 10.2.3 βヘリックス 205 |
| 10.3 α／βドメインタンパク質 207 |
| 10.3.1 バレル型α／βドメイン 207 |
| 10.3.2 オープンシート型α／βドメイン 210 |
| 10.4 α＋βドメインタンパク質 212 |
| 第3部 構造生物学研究の方法論 |
| 第11章 回折・散乱法 217 |
| 11.1 X線結晶解析法 217 |
| 11.1.1 精製・結晶化 217 |
| 11.1.2 X線源 219 |
| 11.1.3 クライオ実験技術 222 |
| 11.1.4 回折強度データ収集 223 |
| 11.1.5 結晶構造解析 225 |
| 11.2 中性子結晶解析法 227 |
| 11.3 電子顕微鏡法 229 |
| 11.4 FEL（自由電子レーザー）法 229 |
| 第12章 分光法 231 |
| 12.1 振動分光法 231 |
| 12.1.1 赤外分光法 232 |
| 12.1.2 ラマン分光法 233 |
| 12.2 磁気共鳴分光法 233 |
| 12.2.1 NMR法 234 |
| 12.2.2 EPR法 235 |
| 第13章 理論的手法－分子動力学法，分子軌道法 237 |
| 第14章 バイオインフォマティクス 239 |
| 14.1 構造・機能予測 239 |
| 14.2 Protein Data Bank（PDB） 241 |
| 14.3 分子の表示 245 |
| 索引 247 |
| 第1部 構造生物学の基礎 |
| 第1章 生物学から構造生物学へ－生物学と構造化学の融合 3 |
| 1.1 構造生物学の重要性とその応用 3 |
図書
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