1. 概観 |
1.1 序 説 1 |
1.2 結晶解析の物理的背景 2 |
1.3 物体からのX線の回折 7 |
1.4 原子構造因子 10 |
1.5 単位胞の構造因子 12 |
1.6 結晶の構造因子 14 |
1.7 逆格子 16 |
1.8 フーリエ変換 19 |
1.9 逆結晶 21 |
1.10 回折像と逆結晶 22 |
1.11 複素数としての構造因子 23 |
1.12 結晶構造解析の立場 25 |
2. 対称 |
2.1 結晶の対称性 27 |
2.2 結晶格子の形 29 |
2.3 軸の変換 36 |
2.4 複合格子による消滅則 41 |
2.5 対称操作の数学的表わし方 42 |
2.6 逆結晶の対称性 46 |
2.7 空間群の表わし方 49 |
2.8 |逆結晶|の対称性 52 |
3. 回折データの測定 |
3.1 X線を取扱う注意 55 |
3.2 結品 57 |
3.2.1 結晶の準備 57 |
3.2.2 結晶の面と軸 60 |
3.3 測定の原理 62 |
3.3.1 4軸型単結晶回折計 63 |
3.3.2 単色X線 65 |
3.3.3 Kα尾の二重線 68 |
3.3.4 4軸型ゴニオメータの幾何学 69 |
3.4 測定の手順 73 |
3.4.1 ピーク探し 74 |
3.4.2 単純逆格子の組み立て 75 |
3.4.3 晶系と空間格子の決定 78 |
3.4.4 |逆結晶|の対称と空間群の決定 94 |
3.4.5 セッティングパラメータと格子定数の糖密決定 98 |
3.4.6 回折強度の測定 101 |
3.5 測定データの補正 106 |
3.5.1 吸収補正 107 |
3.5.2 損傷の補正 111 |
3.6 異常分散効果の利用 113 |
3.6.1 異常分散効果の測定 113 |
3.6.2 絶対構造の決定 118 |
3.6.3 点群の判定 120 |
4. 結晶解析の手はじめ |
4.1 はじめに何をしたらよいか 123 |
4.2 単位胞の中の分子数 125 |
4.3 非対称単位 129 |
4.4 重原子法 131 |
4.4.1 重原子法 131 |
4.4.2 原点の任意性 132 |
4.4.3 チェシャー群 135 |
4.5 パターソンの関数 137 |
4.6 R因子法 144 |
4.7 偽の対称 145 |
4.8 同型置換法と異常分散法 149 |
5. 直接法 |
5.1 直接法の原理 151 |
5.2 直接法の手順 156 |
5.3 規格化構造因子 157 |
5.4 位相の関係式 160 |
5.5 最初の位相 161 |
5.5.1 原点指定の組 161 |
5.5.2 初期位相の指定 164 |
5.6 位相の拡張 165 |
5.7 解けないときの対策 171 |
5.7.1 フーリエ合成の検討 171 |
5.7.2 位相角の分布の検討 172 |
5.7.3 原点と初期位相の選択 172 |
5.7.4 |E|の計算法 173 |
5.8 モンテカルロ法による位相の決定 174 |
5.9 位相と空間群との関係 178 |
5.10 解きにくい構造 180 |
6. 結晶解析の完成 |
6.1 構造の精密化の手順 183 |
6.2 最小二乗法の実行 189 |
6.3 特殊位置の取扱い 191 |
6.3.1 原子多重度の取扱い 191 |
6.3.2 特殊位置の座標 192 |
6.3.3 非等方性温度因子 192 |
6.4 最小二乗法が失敗する場合 201 |
6.5 束縛条件下の最小二乗法 202 |
6.6 分子モデルの作製 204 |
6.7 解析結果の関数 207 |
6.7.1 原子座標の関数 207 |
6.7.2 温度因子の関数 209 |
6.8 解析結果の精度 212 |
7. フーリエ合成と結晶構造因子 |
7.1 フーリエ合成とはどういうことか 214 |
7.2 部分的に正しいフーリエ合成 228 |
7.3 D合成による結合電子の表示 230 |
7.4 光学的フーリエ合成 232 |
7.5 結晶構造因子の計算 236 |
7.6 結晶構造因子の位相と対称操作 240 |
8. 計算プログラムとデータ検索 |
8.1 コンピュータプログラム 241 |
8.2 プログラムシステムの構成 242 |
8.3 結晶データはどうして探したらよいか 243 |
参考文献 246 |
問題解答 247 |
付録 |
1. 特殊な用語についての付記 252 |
2. 論文に記載する項目 254 |
3. 付表 |
付表Ⅰ 空間群決定の表 258 |
付表Ⅱ 単斜晶系の2回軸(2または2)の選び方による空間群記号の変化 268 |
付表Ⅲ 直方品系(斜方品系)で付表Ⅰで求められた空間群名と標準空間群名との関係 268 |
付表Ⅳ チェシャー群と原点の表 269 |
付表Ⅴ 結晶軸の変換にともなう各種のパラメータの変換 273 |
付表Ⅵ 異常分散項と吸収断面積 274 |
付表Ⅶ 非対称単位の表 276 |
索引 279 |