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1.

図書
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1. 生物数学入門 : 差分方程式・微分方程式の基礎からのアプローチ
Linda J.S. Allen著
出版情報: 東京 : 共立出版, 2011.10  xiv, 440p ; 23cm
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2.

図書
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2. 進化ゲームと微分方程式
ホッフバウアー, シグムンド著 ; 竹内康博, 佐藤一憲, 宮崎倫子訳
出版情報: 京都 : 現代数学社, 2001.4  xxxiv, 407p ; 21cm
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3.

図書
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3. 数理モデリング入門 : ファイブ・ステップ法
Mark M. Meerschaert著 ; 佐藤一憲 [ほか] 訳
出版情報: 東京 : 共立出版, 2015.1  xiv, 382p ; 22cm
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第1部 最適化モデル : 1変数の最適化
多変数の最適化
最適化計算法
第2部 動的モデル : 動的モデル入門
動的モデルの解析
動的モデルのシミュレーション
第3部 確率モデル : 確率モデル入門
確率モデル
確率モデルのシミュレーション
第1部 最適化モデル : 1変数の最適化
多変数の最適化
最適化計算法
4.

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4. 進化のダイナミクス : 生命の謎を解き明かす方程式
Martin A. Nowak著
出版情報: 東京 : 共立出版, 2008.2  xii, 333p ; 23cm
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訳者まえがき i
翻訳・監訳者一覧 iii
日本の読者へ iv
まえがき v
1　序章 1
2　進化とは 8
   2.1　繁殖 8
   2.2　淘汰 12
   2.3　突然変異 19
   2.4　交配 21
3　適応度地形と配列空間 25
   3.1　配列空間 26
   3.2　適応度地形 27
   3.3　擬種の方程式 28
   3.4　点突然変異を表す突然変異行列 32
   3.5　適応は配列空間内での局在化である 33
   3.6　擬種の淘汰 35
4　進化ゲーム 39
   4.1　2人ゲーム 41
   4.2　Nash均衡 44
   4.3　進化的に安定な戦略（ESS） 46
   4.4　2つ以上の戦略 47
   4.5　レプリケータダイナミクス 48
   4.6　タカかハトか？ 53
   4.7　Nash均衡は常に存在する 55
   4.8　チキンと雪だまり 55
   4.9　ゲーム理論と生態学 56
5　ジレンマの虜になった人たち 62
   5.1　直接的互恵主義 65
   5.2　Axelrodトーナメント 68
   5.3　応答戦略 71
   5.4　寛容なしっぺ返し 75
   5.5　勝ち残り・負け逃げ 76
6　有限集団 82
   6.1　中立的浮動 82
   6.2　出生死亡過程 86
   6.3　淘汰が一定のときの遺伝的浮動 88
   6.4　進化速度 90
7　有限集団におけるゲーム 94
   7.1　基本モデルと3分の1という数 95
   7.2　有限集団における進化的安定性 100
   7.3　リスク優位性 103
   7.4　しっぺ返し戦略は「いつも裏切る戦略」に侵入できる 105
8　進化グラフ理論 109
   8.1　基本的なアイディア 110
   8.2　最初の観察 110
   8.3　等温定理 116
   8.4　淘汰の抑制 118
   8.5　淘汰の増幅 120
   8.6　循環 121
   8.7　グラフ上のゲーム 124
9　空間ゲーム 128
   9.1　空間配置 128
   9.2　空間的な協力 129
   9.3　侵入 134
   9.4　動的なフラクタルと進化万華鏡 136
   9.5　協力のビッグバン 138
   9.6　他の幾何 140
   9.7　他の更新ルール 142
   9.8　VirtualLabs（仮想実験室） 145
10　HIV感染症 147
   10.1　抗原の変異 151
   10.2　多様性閾値 154
11　毒性の進化 166
   11.1　感染生物学の基本モデル 168
   11.2　淘汰は基本再生産数を最大化する 171
   11.3　重複感染 173
   11.4　重複感染の解析的なモデル 175
   11.5　ダイナミクスの複雑さ 181
12　癌の進化ダイナミクス 184
   12.1　癌遺伝子 192
   12.2　リニア過程 196
   12.3　数値例 197
   12.4　癌抑制遺伝子 199
   12.5　遺伝的不安定 206
13　言語の進化 221
   13.1　形式言語理論 223
   13.2　学習理論 233
   13.3　言語の進化 241
   13.4　新しい規則の進化 250
   13.5　普遍文法の進化 252
   13.6　再帰性の進化 253
14　まとめ 256
関連書籍と論文の紹介 263
   2　進化とは 263
   3　適応度地形と配列空間 264
   4　進化ゲーム 265
   5　ジレンマの虜になった人たち 266
   6　有限集団 268
   7　有限集団におけるゲーム 269
   8　進化グラフ理論 270
   9　空間ゲーム 270
   10　HIV感染症 271
   11　毒性の進化 272
   12　癌の進化ダイナミクス 274
   13　言語の進化 276
参考文献 280
付録 : 微分方程式の安定性理論とシミュレーション 312
   1　平衡点の安定性 312
   2　局所安定性 314
   3　シミュレーション 316
   4　さらに詳しく学ぶために 318
索引 321
訳者まえがき i
翻訳・監訳者一覧 iii
日本の読者へ iv
5.

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5. 個体群生態学入門 : 生物の人口論
John H. Vandermeer, Deborah E. Goldberg著 ; 佐藤一憲 [ほか] 訳
出版情報: 東京 : 共立出版, 2007.3  xi, 274p ; 21cm
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序文 i
訳者序文 v
1　個体群動態の原理 1
   1.1　密度非依存 : 指数方程式 3
   1.2　密度依存 : 種内競争 10
   1.2.1　ロジステイック方程式 14
   1.2.2　収量-密度の関係 20
   1.2.3　密度依存と死亡率 : 間引き則 26
2　生活史の解析 33
   2.1　生存に投資するか再生産に投資するか : γ-K淘汰説 25
   2.2　再生産コスト 38
   2.3　最適再生産スケジュール 41
3　推移行列・齢構成モデル 49
   3.1　個体群推移行列 50
   3.2　年齢構造以外の推移行列 58
   3.3　固有ベクトル，繁殖価，感度，弾力性 65
   3.4　個体群推移行列の実際問題への適用 68
   3.4.1　ドールシープ : 静的生命表 69
   3.4.2　熱帯雨林 : 動的生命表 71
   3.4.3　アメリカブナ : 動的生命表による仮説のテスト 73
   3.5　密度依存性を持つ構造化モデル 75
   3.5.1　単純な年齢構造化モデルに対する密度依存性 76
   3.5.2　サイズ分布を持つ個体群に対する密度依存性 79
   3.5.3　生育段階構造化モデルに対する密度依存性の例 86
   付録 : 基本的な行列の演算 88
   ●行列の乗法 88
   ●行列の加法・減法 90
   ●単位行列 90
   ●行列式 91
4　個体群動態に現れる「ダイナミクス」の詳説 93
   4.1　平衡と安定性の直感的な考え方 95
   4.2　固有値 : ダイナミクスの解析における鍵となる概念 106
   4.3　1次元写像における平衡と安定性の基本概念 112
   4.3.1　1次元写像 113
   4.3.2　ロジステイック写像の安定性と平衡 122
   4.3.3　ロジステイック写像の吸引域 125
   4.4　構造安定性 127
   4.5　分岐図 134
   4.6　注釈 140
5　空間パターンとメタ個体群 147
   5.1　ポアソン分布 150
   5.2　スケールの問題 155
   5.3　メタ個体群 159
   5.3.1　メタ個体群モデルの仮定 163
   5.3.2　救出効果と繁殖体の雨 165
6　捕食者-被食者（消費者-資源）相互作用 169
   6.1　捕食者-被食者相互作用 : 第1原理 171
   6.2　密度依存 176
   6.3　機能的反応 178
   6.4　機能的反応と密度依存 183
   6.5　捕食者-被食者理論の応用におけるパラドックス 185
   6.6　捕食者-被食者ダイナミクス : グラフ法 187
   6.7　離散時間捕食者-被食者相互作用 194
7　疫学 197
   7.1　直接的な病気の伝播 198
   7.2　間接的な病気の伝播 204
8　競争と共生 209
   8.1　競争 : 第1原理 210
   8.2　競争的生産則 : 農学への競争理論の応用 220
   8.3　共生 222
   8.4　競争 : 詳論 226
9　この本で書かれていたこと 241
用語解説 247
参考文献 251
索引 263
序文 i
訳者序文 v
1　個体群動態の原理 1
6.

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6. つながりに隠れた現象をひもとく
林幸雄編著 ; 大久保潤 [ほか] 著
出版情報: 東京 : 近代科学社, 2007.12  viii, 212p ; 21cm
シリーズ名: ネットワーク科学の道具箱 ; [1]
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7.

図書
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7. 数理モデル解析の講究
齋藤保久, 佐藤一憲, 瀬野裕美著
出版情報: 東京 : 共立出版, 2017.9  v, 324p ; 26cm
シリーズ名: 数理生物学講義 ; 展開編
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第1章 : 出生・死亡過程の数理モデル
第2章 : 捕食過程の数理モデル
第3章 : 構造をもつ個体群の数理モデル
第4章 : 構造を伴う感染症伝染ダイナミクスモデル
第5章 : 個体群ダイナミクスの格子モデル
付録
第1章 : 出生・死亡過程の数理モデル
第2章 : 捕食過程の数理モデル
第3章 : 構造をもつ個体群の数理モデル
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