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1.

図書

図書
Setsuo Arikawa, Shinichi Morishita (eds.)
出版情報: Berlin ; New York : Springer, c2000  xii, 332 p. ; 24 cm
シリーズ名: Lecture notes in computer science ; 1967 . Lecture notes in artificial intelligence
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Invited Papers
A Survey of Association-Rule Mining / Jeffrey D. Ullman
Degrees of Belief, Random Worlds, and Maximum Entropy / Joseph Y. Halpern
Discovery and Deduction / Masami Hagiya ; Koichi Takahashi
Regular Papers
Integrating Information Visualization and Retrieval for Discovering Internet Sources / Hayato Ohwada ; Fumio Mizoguchi
A Unifying Approach to HTML Wrapper Representation and Learning / Gunter Grieser ; Klaus P. Jantke ; Steffen Lange ; Bernd Thomas
Discovery of Web Communities Based on the Co-occurrence of References / Tsuyoshi Murata
Clustering and Visualization of Large Protein Sequence Databases by Means of an Extension of the Self-Organizing Map / Panu Somervuo ; Teuvo Kohonen
A Simple Greedy Algorithm for Finding Functional Relations: Efficient Implementation and Average Case Analysis / Tatsuya Akutsu ; Satoru Miyano ; Satoru Kuhara
Graph-Based Induction for General Graph Structured Data and Its Application to Chemical Compound Data / Takashi Matsuda ; Tadashi Horiuchi ; Hiroshi Motoda ; Takashi Washio
Discovering Characteristic Expressions from Literary Works: A New Text Analysis Method beyond N-Gram Statistics and KWIC / Masayuki Takeda ; Tetsuya Matsumoto ; Tomoko Fukuda ; IchiroNanri
Classifying Scenarios Using Belief Decision Trees / Zied Elouedi ; Khaled Mellouli
A Practical Algorithm to Find the Best Subsequence Patterns / Masahiro Hirao ; Hiromasa Hoshino ; Ayumi Shinohara ; Setsuo Arikawa
On-Line Estimation of Hidden Markov Model Parameters / Jun Mizuno ; Tatsuya Watanabe ; Kazuya Ueki ; Kazuyuki Amano ; Eiji Takimoto ; Akira Maruoka
Computationally Efficient Heuristics for If-Then Rule Extraction from Freed-Forward Neural Networks / Hyeoncheol Kim
Language Learning with a Neighbor System / Yasuhito Mukouchi ; Masako Sato
Application of Multivariate Maxwellian Mixture Model to Plasma Velocity Distribution Function / Genta Ueno ; Nagatomo Nakamura ; Tomoyuki Higuchi ; Takashi Tsuchiya ; Shinobu Machida ; Tohru Araki
Knowledge Discovery from fMRI Brain Images by Logical Regression Analysis / Hiroshi Tsukimoto ; Mitsuru Kakimoto ; Chie Morita ; Yoshiaki Kikuchi ; Eiko Hatakeyama ; Yoshifumi Miyazaki
Human Discovery Processes Based on Searching Experiments in Virtual Psychological Research Environment / Kazuhisa Miwa
Poster Papers
Prediction of Binding Affinities for Protein-ligand Complexes with Neural Network Models / Vladimir V. Krepets ; Natalya V. Belkina
Automatic and Accurate Determination of the Onset Time of the Quasi-periodic Oscillation
TheRoleofChoiceinDiscovery / Judith Devaney
Search for New Methods for Assignment of Complex Molecular Spectra / Takehiko Tanaka
Computational Analysis for Discovery on the Plasma Waves Observed by Scientific Satellites / Yoshiya Kasahara ; Ryotaro Niitsu ; Yousuke Akimoto ; Toru Sato
Direction Finding of the Waves in Plasma Using Energy Function / Yoshitaka Goto
Coping the Challenge of Mutagenes Discovery with Gil I.A for Windows / Premysl Zak ; Jaroslava Halova
Discovering Interpretable Rules that Explain Customers' Brand Choice Behavior / Yukinobu Hamuro ; Naoki Katoh ; Katsutoshi Yada
Mining for 4ft Association Rules / Jan Rauch ; Milan Simunek
Rule Discovery Technique Using Genetic Programming Combined with Apriori Algorithm / Ayahiko Niimi ; Eiichiro Tazaki
Discovery of M-of-N Concepts for Classification / Nobuhiro Yugami
Issues in Organizing a Successful Knowledge Discovery Contest / Einoshin Suzuki
Knowledge Integration of Rule Mining and Schema Discovering / Kohei Maruyama ; Kuniaki Uehara
Discovery of Correlation from Multi-stream of Human Motion / Mitsuomi Shimada
An Appropriate Abstraction for Constructing a Compact Decision Tree / Yoshimitsu Kudoh ; Makoto Haraguchi
Extraction Positive and Negative Keywords for Web Communities / Daisuke Ikeda ; Sachio Hirokawa
Nonequilibrium Thermodynamics from Time Series Data Analysis / Hiroshi H. Hasegawa ; Yukari Ishimiya ; Takeshi Saito
Automatic Determination Algorithm for the Optimum Number of States in NL-HMnet / Motoyuki uzuki ; Shozo Makino
Comparative Study of Automatic Acquisition Methods of Image Processing Procedures / Toshihiro Hamada ; Akinobu Shimizu ; Toyofumi Saito ; Jun-ichi Hasegawa ; Jun-ichiro Toriwaki
Extraction of Authors' Characteristics from Japanese Modern Sentences via N-gram Distribution / Tsukasa Matsuura ; Yasumasa Kanada
Combination Retrieval for Creating Knowledge from Sparse Document Collection / Naohiro Matsumura ; Yukio Ohsawa
Discovery of Nominally Conditioned Polynomials Using Neural Networks, Vector Quantizers and Decision Trees / Kazumi Saito ; Ryohei Nakano
Author Index
Invited Papers
A Survey of Association-Rule Mining / Jeffrey D. Ullman
Degrees of Belief, Random Worlds, and Maximum Entropy / Joseph Y. Halpern
2.

図書

図書
森下真一, 宮野悟編
出版情報: 東京 : 共立出版, 2001.6  xv, 299p ; 28cm
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3.

図書

図書
森下真一著
出版情報: 東京 : 共立出版, 1994.1  vi, 205p ; 22cm
シリーズ名: 情報数学講座 ; 10
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4.

図書

東工大
目次DB

図書
東工大
目次DB
森下真一, 阿久津達也編集
出版情報: 東京 : 羊土社, 2008.5  225, 4p ; 26cm
シリーズ名: 実験医学 ; 第26巻第7号 (2008増刊)
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序 森下真一
概論 観測技術の進歩からバイオインフォマティクスの潮流を読む 森下真一 20(986)
   1.データベース化の支援
   2.超並列計算の必要性
   3.超高速シークエンサーの今後
   4.ヒトゲノム多様性の分析
   5.転写物発現量の網羅的定量化
   6.困難な観測を補う予測技術
第1章 DNA
1. ゲノムブラウザー バドルル アーサン,山田智之,森下真一 24(990)
   1.活用されるさまざまなブラウザー
2. 国際HapMapプロジェクト 角田達彦,田中敏博,中村祐輔 32(998)
   1.HapMapデータ
   2.関連解析のためのタグSNP同定
   3.組換え率の推定と遺伝子機能
   4.自然選択
   5.近年の共通祖先由来の共有セグメント
3. メタゲノムデータベース 黒川 顕,服部正平 37(1003)
   1.メタゲノムブロジエクトの世界動向
   2.メタゲノムデータベース
4. ゲノム進化のデータベース 中谷洋一郎 43(1009)
   1.進化的に保存されたゲノム配列からの機能因子の発見
   2.進化的に保存されていない機能因子の発見
   3.全ゲノム重複による新機能の獲得
5. QTL解析とデータベース 中谷明弘 49(1015)
   1.QTL解析-量的形質と質的形質
   2.区間マッピング
   3.複数の遺伝子座間の関係
6. ゲノムアセンブラと新型シークエンサーを使用したゲノムシークエンシングの未来 笠原雅弘 55(1021)
   1.全ゲノムショットガン法の概要とその歴史
   2.ゲノムアセンブラの原理
   3.新型シークエンサーの登場と全ゲノムショットガンアセンブリ
7. 超高速シークエンサーの原理と情報処理 曲 薇,バドルル アーサン,森下真一 67(1033)
   1.ひろがる超高速シークエンサーの応用
   2.SOLiDの原理
   3.Solexaの原理
   4.短いリードのゲノムヘのアラインメント問題
8. ゲノム配列のマルチプルアラインメント 後藤 修,市瀬夏洋 77(1043)
   1.局所大域的ゲノム配列アラインメント
   2.局所マルチプルアラインメント
9. 遺伝子発見 矢田哲士 84(1050)
   1.遺伝子の発見法
   2.遺伝子発見プログラム
第2章 RNA
1. 完全長cDNAデータベース 武田淳一,今西 規,五篠堀 孝,鈴木 穣,菅野純夫 90(1056)
   1.NCBl
   2.Ensembl
   3.UCSC Genome Browser Database
   4.H-Invitational Database
   5.FANTOM
   6.その他の完全長cDNAデータベース
2. 革命的超高速シークエンサーによるSAGE法の進展 橋本真一,松島綱治 96(1062)
   1.SAGE法の概略
   2.SAGE関連技術
   3.次世代シークエンサーとSAGE法
3. RNA干渉実験のためのウェブツール 内藤雄樹,程 久美子 104(1070)
   1.siDirect : 哺乳類細胞でRNAi活性が高く標的遺伝子に特異的なsiRNAの設計ツール
   2.dsCheck : 長い2本鎖RNAから生成されるsiRNAのオフターゲット評価ツール
   3.siVirus : ウイルスを標的とするsiRNAの設計ツール
4. 機能性RNAデータベース 金 大真,浅井 潔 112(1078)
   1.ncRNA予測
   2.機能性RNAデータベース
5. 二次構造に基づく機能性RNAの配列解析 佐藤健吾,榊原康文 121(1087)
   1.機能性RNA配列のアラインメントと二次構造予測
   2.RNA遺伝子の探索
第3章 タンパク質
1. タンパク質の機能部位の予測 木下賢吾 127(1093)
   1.類似性検索を利用する方法
   2.ポケット検出法
   3.ドッキング法
2. タンパク質とDNAの結合予測 皿井明倫,河野秀俊 133(1099)
   1.DNA結合タンパク質の予測
   2.塩基配列情報に基づく結合配列予測法
   3.相互作用情報を用いた予測法
   4.構造情報を用いた予測法
3. アミノ酸配列に基づくタンパク質の細胞内局在予測 中井謙太,ポール ホートン 140(1106)
   1.予測法の原理と分類
   2.最近の動向
   3.最近のわれわれの研究
   4.今後の課題
第4章 エピジャネティクス
1. DNAメチル化の網羅的解析技術 三浦史仁,伊藤隆司 147(1113)
   1.メチル化シトシンの検出原理
   2.メチル化依存的な切断活性を有する制限酵素を利用する方法
   3.メチル化シトシンに対する親和性をもったタンパク質を利用する方法
   4.バイサルファイト処理による検出
2. DNAメチル化を中心とした網羅的なエピゲノム解析 佐藤晋也,八木慎太郎,塩田邦郎 155(1121)
   1.DNAメチル化プロフィールとエピゲノム
   2.網羅的なエピゲノム解析
3. クロマチン修飾の網羅的解析技術 油谷浩幸 162(1128)
   1.タイリングアレイを用いた網羅的エピゲノム解析
   2.高速シークエンサーによるエピゲノム解析
第5章 システム生物学
1. パスウェイのモデル化とシミュレーションツール 長崎正朗,斉藤あゆむ,宮野悟 169(1135)
   1.パスウェイのシミュレーションツールの表と裏
   2.Cell Illustratorの開発
   3.生命システムの知識化とオントロジー
2. KEGG : 生命システム情報統合データベース 橋本浩介,五斗 進,金久 實 176(1142)
   1.生命システムをいかに表現するか
   2.ゲノム情報からシステム情報へ
   3.ゲノム情報から生体分子化合物情報へ
   4.ケミカル情報
3. Wikiによるフラボノイドのデータベース 有田正規,諏訪和大 182(1148)
   1.データベースの定義
   2.MediaWikiの構造
   3.MediaWikiを用いたデータベース
   4.MediaWikiにおける関係演算の実現
4. メタボローム解析のための質量分析スペクトル・データベース : MassBank 蓬尚幸,西岡孝明 189(1155)
   1.MassBankの特徴
   2.MassBankのコンテンツ
   3.MassBankのサービス
第6章 文献検索とゲノム言語
1. 医学生物学分野におけるシソーラスとテキストマイニング技術の開発 小池麻子,高木利久 195(1161)
   1.シソーラス/辞書構築
   2.情報抽出開発
   3.潜在知識発見/仮説生成
2. PURE : PubMed文献検索支援システム 馬見塚 拓,米屋 陸 201(1167)
   1.確率モデルによるクラスタリング
   2.レコメンデーション
   3.PURE : PubMed文献レコメンデーションシステム
3. ゲノムと言語の学際的研究 Short Articles
Ⅰ 転移因子によるゲノム言語の構築と進化 二橋美瑞子,藤原晴彦 207(1173)
   1.カイコの転移因子の分類
Ⅱ 進化計算と這伝子ネットワーク推定 伊庭斉志 210(1176)
   1.遺伝子ネットワーク対話型推定システム
   2.新しい遺伝子ネットワーク表示システム
Ⅲ タンパク質糖鎖修飾の新たな意義-細胞内糖タンパク質品質管理機構 山本一夫 213(1179)
   1.異なる意義をもつ糖鎖修飾
   2.糖タンパク質品質管理機構
Ⅳ 近縁複数全ゲノム配列比較によるゲノム進化ダイナミクスの解明 小林一三 216(1182)
   1.ゲノム・アイデンティティーとパラログ・クラスターの進化
   2.複雑な大規模ゲノム多型の理解
   3.ゲノム再編に関与する新しいタンパク質
Ⅴ 下水処理プロセスの微生物群集-ゲノム解析で見えるもの見えないもの 佐藤弘泰,味埜 俊 220(1186)
   1.バイオインフォマティクスやゲノム解析のもたらす成果
   2.ゲノム解析だけでは見えない部分
データベース・ソフトウエア INDEX 222(1188)
索引 223(1189)
序 森下真一
概論 観測技術の進歩からバイオインフォマティクスの潮流を読む 森下真一 20(986)
   1.データベース化の支援
文献の複写および貸借の依頼を行う
 文献複写・貸借依頼