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図書

図書
松永是, ゲノム工学研究会監修
出版情報: 東京 : シーエムシー, 2000.7-2001.7  2冊 ; 27cm
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東工大
目次DB

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東工大
目次DB
松永是, ゲノム工学研究会監修
出版情報: 東京 : シーエムシー出版, 2005.12-  冊 ; 21cm
シリーズ名: CMCテクニカルライブラリー ; 209, 240
所蔵情報: loading…
目次情報: 続きを見る
   総論編
第1章DNAチップと応用 松永是
   1ポストシークエンス時代のバイオテクノロジー 3
   2ゲノム工学研究会 3
   3DNAチップ技術の将来 5
   4おわりに 8
第2章DNA計測技術の動向 神原秀記、釜堀政男
   1はじめに 9
   2応用面からみたDNA計測とDNA計測法 9
   3最近話題のDNA計測法 14
   3.1キャピラリーアレー電気泳動装置 14
   3.2電気泳動チップ 15
   3.3DNAチップ 15
   3.4ビーズ技術 16
   3.5質量分析 17
   3.6パイロシーケンシング 17
   4おわりに 19
第3章DNAチップの開発動向 川口竜二
   1はじめに 21
   2DNAチップ法と遺伝子解析プロセス 21
   3DNAチップ解析の各工程における技術開発 23
   4DNAチップの現状と方向性 25
   5おわりに 27
第4章生命体ソフトウェアの開発 大竹久夫、滝口昇
   1はじめに 30
   2大腸菌とゲノム情報 31
   3バーチャル大腸菌システム 32
   3.1大腸菌の機能ルールとRuleKB 33
   3.2機能ルールを呼び出すためのルール 35
   4Vestの実行例 36
   5おわりに 39
   DNAチップ・装置編
第5章DNAマイクロアレイの実際とその応用 久原哲
   1はじめに 43
   2マイクロアレイの技術 44
   2.1マイクロアレイの基本技術 44
   2.2マイクロアレイの実際 45
   Ⅰマイクロアレイ用DNAの調製 45
   ⅡRNA試料からのターゲット調製 46
   Ⅲマイクロアレイの作製およびハイブリダイゼーション 47
   Ⅳスポットの定量 49
   3チップの応用 50
   3.1RNA発現解析 50
   3.2DNAへの応用 53
   4今後の展開 53
第6章ダイヤモンドを用いた保存型DNAチップ 高橋浩二郎
   1はじめに 55
   2なぜ、ダイヤモンド? 56
   3オリゴDNAの固定化 57
   4cDNAライブラリーの固定化 58
   5二本鎖DNAの固定化 59
   6二本鎖cDNAライブラリーの考察 60
   7固定化gDNAチップとレプリカ・チップの考察 62
   8バーチャル自動遺伝子診断装置 63
   9将来の展望 65
第7章磁気ビーズ利用DNAチップ 竹山春子、松永是
   1はじめに 67
   2従来型DNAチップ 68
   3ビーズを用いた遺伝子検出 69
   4DNA固定化磁性細菌微粒子を用いた遺伝子検出法 69
   4.1種特異的DNAプローブ固定化磁性細菌微粒子を用いたマグロ魚種判別 70
   4.2磁気ビーズマイクロアレイ 72
   5おわりに 75
第8章電気化学法によるDNA検出 竹中繁織
   1新規DNA結合性リガンドの開発 77
   2検出装置と測定 78
   3DNAプローブ修飾電極の作成 79
   4ハイブリダイゼーション反応 80
   5DNA検出例 80
   5.1オリゴヌクレオチドの検出 80
   5.2プラスミドDNA上の目的遺伝子配列の検出と定量 81
   6検出操作の簡略化 82
   7超高感度化 84
   8PCR産物の検出例 86
   9DNAマイクロアレイへの応用 87
第9章自動装置 澤上一美、田島秀二
   1はじめに 88
   2DNAチップ技術の基本 88
   3一貫した自動化システム構築への将来展望 97
   4まとめ 98
第10章マイクロマシンによるDNA解析 養王田正文
   1はじめに 100
   2電気泳動とPCRのマイクロ化 101
   3集積化DNA解析チップ 105
   4DNA解析をマイクロ化することのメリットとデメリット 108
   応用編
第11章医療計測への応用 川口竜二、福島雅夫
   1病原微生物同定解析への応用 114
   2シゲラ、サルモネラ菌のDNAチップ法による検出・同定 116
   3発現解析の診断への応用 117
   4遺伝子変異解析への応用 121
   5BACライブラリーチップの染色体異常解析への応用 121
   6まとめ 122
第12章SNPs(一塩基多型)解析 馬場嘉信
   1はじめに 124
   2ゲノムシークエンシングからSNP解析へ 125
   3DNAチップによるSNP解析 127
   4集積型マイクロチップによるSNP解析 131
   5おわりに 132
第13章SELDIプロテインチップ(R)システムによるバイオマーカー探索技術 有國尚、斉藤賢治
   1はじめに 134
   2SELDIプロテインチップ技術 135
   3タンパク質バイオマーカーの探索と分析の手法 137
   4SELDIプロテインチップ(R)技術を用いたマーカー探索 138
   5SELDIプロテインチップ(R)を用いたマーカー探索の応用例 140
   5.1前立腺ガン 140
   5.2神経膠腫 146
   6プロテオーム解析の現状と問題点 146
第14章遺伝子発現プロファイリング 大門尚志
   1はじめに 150
   2DNAチップの原理 150
   3DNAチップのための装置とソフトウェア 152
   3.1DNAチップ作製装置 152
   3.2DNAチップ読み取り装置 152
   3.3データ解析ソフト 153
   3.4DNAチップ 153
   4DNAチップを用いた遺伝子発現モニタリング 153
   4.1DNAチップ 153
   4.2発現実験の手順 154
   4.3データ解析 156
   5DNAチップの応用と課題 156
第15章結核菌の耐性診断 鈴木定彦、市原竜生、田丸亜貴、アミン・ルフル、勝川千尋、牧野正直、阿部千代治
   1はじめに 159
   2結核菌の多剤耐性獲得機序 160
   3結核菌の薬剤耐性に関与する遺伝子 161
   3.1イソニアジド(INH)耐性 161
   3.2リファンピシン(RFP)耐性 161
   3.3ピラジナミド(PZA)耐性 162
   3.4エタンブトール(EB)耐性 162
   3.5ストレプトマイシン(SM)耐性 162
   3.6カナマイシン(KM)耐性 162
   3.7その他の薬剤に対する耐性に関与する遺伝子 162
   4これまでの遺伝子工学的手法による結核菌の耐性迅速診断 163
   5DNAチップによる薬剤耐性結核菌の迅速鑑別 163
   6おわりに 169
第16章環境ゲノム 加藤貴彦、今井博久
   1はじめに 171
   2疫学と分子疫学 171
   3発癌感受性素因について 172
   4尿路上皮癌の発癌感受性素因 173
   5分子疫学研究の予防医学的意義 175
   6発癌感受性研究の問題点 176
   (1)癌原性化学物質と代謝の多様性 176
   (2)曝露量の評価 176
   (3)遺伝子多型の人種差 177
   (4)遺伝子解析の倫理的な問題 177
   7DNAチップ技術への期待 178
   8おわりに 179
第17章出芽酵母遺伝子のマイクロアレイによる発現解析 村上康文
   1はじめに 180
   2出芽酵母における遺伝子発現プロフィールの解析 181
   3オリゴDNAマイクロアレイによる遺伝子発現プロフィールの解析 182
   4マイクロアレイシステムの改良の試み 186
第18章好熱古細菌ゲノム解析 河原林裕
   1はじめに 189
   2世界での好熱菌ゲノム解析 189
   3解析対象とした超好熱古細菌 190
   4好熱菌ゲノムの全塩基配列決定 192
   5ゲノム解析結果 193
   6各菌のゲノム解析から明らかとなった特長 194
   7古細菌間のゲノム比較 196
   8ゲノム解析データの利用-新規機能の探索- 198
   9ゲノム解析データの利用-機能解析に向けて- 199
   10ゲノム解析の今後 200
第19章cDNAライブラリー 今本文男
   1はじめに 202
   2発現遺伝子のcDNA作製 203
   3細胞の発現遺伝子像を反映するcDNAライブラリー 204
   4cDNAライブラリーのrare cDNA濃縮 206
   5cDNAライブラリーのrare cDNA捕捉 207
   6完全長cDNAのライブラリー作製 209
   7おわりに 210
第20章2D-PAGE画像処理におけるBioinformaticsの重要性 高橋勝利
   1はじめに 213
   22D-PAGEによるプロテオーム解析 214
   2.12D-PAGEによる蛋白質分離 215
   2.2質量分析による蛋白質スポットの同定 216
   2.32D-PAGEマップの比較によるプロテオーム解析
   32D-PAGE画像のコンピュータ画像処理 218
   3.1スポットの自動認識と形状推定 219
   3.2スポットパターンの自動照合 222
   3.3マスタースポットパターンの自動生成 224
   4まとめ 224
   総論編
第1章DNAチップと応用 松永是
   1ポストシークエンス時代のバイオテクノロジー 3
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