| 1.生物化学に共通する反応機構 1 |
| 1.1 生物化学で重要な官能基 3 |
| 1.2 酸と塩基,求電子体と求核体 5 |
| Bronsted-Lowryの酸と塩基 5 |
| Lewisの酸と塩基 8 |
| 求電子体と求核体 9 |
| 1.3 求電子付加反応の機構 10 |
| 1.4 求核置換反応の機構 12 |
| 1.5 求核カルボニル付加反応の機構 15 |
| 求核付加反応 16 |
| アルコール生成 18 |
| イミン(Schiff塩基)生成 18 |
| アセタール生成 20 |
| 共役(1,4)求核付加 22 |
| 1.6 求核アシル置換反応の機構 23 |
| 1.7 カルボニル縮合反応の機構 25 |
| 1.8 脱離反応の機構 28 |
| 1.9 酸化と還元 30 |
| 問題 32 |
| 2.生体分子 37 |
| 2.1 キラリティーと生体分子 38 |
| 鏡像異性体 39 |
| ジアステレオマー,エピマー,メソ化合物 40 |
| プロキラリティー 43 |
| 2.2 生体分子:脂質 46 |
| トリアシルグリセロール 46 |
| その他の脂質:テルペノイド,ステロイド,プロスタグランジン 47 |
| 2.3 生体分子:炭水化物 49 |
| 炭水化物の立体構造 50 |
| 単糖のアノマー 51 |
| 二糖と多糖 54 |
| デオキシ糖,アミノ糖 55 |
| アミノ糖 55 |
| 2.4 生体分子:アミノ酸,ペプチド,タンパク質 56 |
| アミノ酸 56 |
| ペプチドとタンパク質 60 |
| 2.5 生体分子:核酸 64 |
| DNA:デオキシリボ核酸 66 |
| RNA:リボ核酸 68 |
| 2.6 生体分子:酵素,補酵素,共役反応 69 |
| 酵素 69 |
| 補酵素 71 |
| 共役反応と高エネルギー化合物 74 |
| 問題 77 |
| 3.脂質代謝 83 |
| 3.1 トリアシルグリセロールの消化と輸送 85 |
| トリアシルグリセロールの加水分解 85 |
| トリアシルグリセロールの再合成 89 |
| 3.2 トリアシルグリセロールの異化:グリセロールの運命 92 |
| 3.3 トリアシルグリセロールの異化:脂肪酸の酸化 95 |
| 3.4 脂肪酸の生合成 103 |
| 3.5 テルペノイドの生合成 112 |
| イソペンテニル二リン酸へのメバロン酸経路 112 |
| イソペンテニル二リン酸へのデオキシキシルロースリン酸経路 117 |
| イソペンテニル二リン酸のテルペノイドヘの変換 124 |
| 3.6 ステロイドの生合成 129 |
| ファルネシル二リン酸のスクアレンヘの変換 129 |
| スクアレンのラノステロールへの変換 131 |
| ノート 酵素の三次元構造を表示する 88 |
| 参考文献 137 |
| 問題 140 |
| 4.炭水化物代謝 145 |
| 4.1 複雑な炭水化物の消化と加水分解 146 |
| 4.2 グルコースの代謝:解糖 148 |
| 4.3 ピルピン酸の変換 161 |
| ピルビン酸から乳酸へ 161 |
| ピルビン酸からエタノールへ 162 |
| ピルビン酸からアセチルCOA 162 |
| 4.4 クエン酸回路 167 |
| 4.5 グルコースの生合成:糖新生 174 |
| 4.6 ペントースリン酸経路 183 |
| 4.7 光合成:還元的ペントースリン酸(カルビン)回路 190 |
| 参考文献 196 |
| 問題 198 |
| 5.アミノ酸代謝 201 |
| 5.1 アミノ酸の脱アミノ化 203 |
| アミノ酸のアミノ基転移反応 203 |
| グルタミン酸の酸化的脱アミノ化反応 207 |
| 5.2 尿素回路 207 |
| 5.3 アミノ酸炭素鎖の異化 211 |
| アラニン,セリン,グリシン,システイン,トレオニン,トリプトファン 212 |
| アスパラギン,アスパラギン酸 228 |
| グルタミン,グルタミン酸,アルギニン,ヒスチジン,プロリン 229 |
| バリン,イソロイシン,ロイシン 232 |
| メチオニン 235 |
| リシン 240 |
| フェニルアラニン,チロシン 241 |
| 5.4 非必須アミノ酸の生合成 246 |
| アラニン,アスパラギン酸,グルタミン酸,アスパラギン,グルタミン,アルギニン,プロリン 248 |
| セリン,システイン,グリシン 249 |
| 5.5 必須アミノ酸の生合成 251 |
| リシン,メチオニン,トレオニン 251 |
| イソロイシン,バリン,ロイシン 257 |
| トリプトファン,フェニルアラニン,チロシン 260 |
| ヒスチジン 268 |
| ノート 鉄錯体の酸化状態 219 |
| ノート PLPの関与する反応 228 |
| 参考文献 270 |
| 間題 274 |
| 6.ヌクレオチド代謝 277 |
| 6.1 ヌクレオチドの異化 279 |
| ピリミジン:シチジン,ウリジン,チミジン 279 |
| プリン:アデノシン,グアノシン 282 |
| 6.2 ピリミジンリボヌクレオチドの生合成 284 |
| ウリジン一リン酸 284 |
| シチジン三リン酸 288 |
| 6.3 プリンリボヌクレオチドの生合成 289 |
| イノシン一リン酸 289 |
| アデノシン一リン酸とグアノシン一リン酸 294 |
| 6.4 デオキシリボヌクレオチドの生合成 295 |
| デオキシアデノシン,デオキシグアノシン,デオキシシチジン,デオキシウリジン二リン酸 295 |
| チミジン一リン酸 298 |
| 参考文献 299 |
| 問題 301 |
| 7.天然物の生合成 305 |
| 7.1 ペニシリンとセファロスボリンの生合成 308 |
| ペニシリン 310 |
| セファロスボリン 315 |
| 7.2 モルヒネの生合成 316 |
| 7.3 プロスタグランジンなどのエイコサノイド類の生合成 327 |
| 7.4 エリスロマイシンの生合成 332 |
| 7.5 補酵素B12などのテトラピロール類の生合成 341 |
| ウロボルフィリノーゲンⅢ(ウロゲンⅢ) 342 |
| へム 346 |
| 補酵素B12 349 |
| 参考文献 359 |
| 問題 362 |
| 8.生体内変換反応のまとめ 367 |
| 加水分解,エステル化,チオエステル化,アミド化 368 |
| カルボニル縮合 369 |
| カルボキシ化と脱炭素 371 |
| アミノ化と脱アミノ化 373 |
| 一炭素転移 374 |
| 転位 376 |
| 異性化とエピマー化 377 |
| カルボニル化合物の酸化と還元 379 |
| 金属錯体によるヒドロキシ化と他の酸化反応 381 |
| 付録 387 |
| 付録A Swiss PDB Viewerよるタンパク質構造の表示 387 |
| 付録B KGGとBRENDAAデータベースの利用法 395 |
| 付録C 章末問題の解答 399 |
| 付録D 本書で用いる略号 429 |
| 索引 433 |
