| 口絵 i |
| はじめに v |
| 第1章 適応による形質の変化が個体群と群集の動態に影響する（吉田丈人・近藤倫生） 1 |
| 1 適応による形質変化が生物間相互作用に影響する 2 |
| （1）適応とは 2 |
| （2）適応のメカニズムと形質変化 2 |
| （3）形質変化による相互作用の改変 5 |
| 2 形質変化が個体群動態に影響する―単純な系の場合 8 |
| （1）可塑性が引き起こす個体群動態 8 |
| （2）学習が引き起こす個体群動態 9 |
| （3）進化が引き起こす個体群動態 10 |
| （4）個体群動態への影響は形質変化のメカニズムに依存するか？ 13 |
| 3 複雑な生物群集における形質変化の役割 14 |
| （1）群集における適応 14 |
| （2）食物網における適応 16 |
| （3）適応的捕食と食物網の構造 18 |
| （4）適応的な形質の変化と栄養モジュールの動態 20 |
| （5）食物網の動態と適応 26 |
| 4 今後の展望 30 |
| （1）形質変化の群集内不均一性 30 |
| （2）形質変化の時空間スケールと個体群や群集への影響 34 |
| （3）トレードオフの重要性 37 |
| （4）まとめ 39 |
| 第2章 適応と生物群集をむすぶ間接相互作用（石原道博・大串隆之） 41 |
| 1 はじめに 42 |
| 2 間接相互作用とは何か？ 43 |
| 3 形質介在型の間接相互作用はなぜ普遍的か？ 44 |
| （1）陸域生態系における間接相互作用 45 |
| （2）水域生態系における間接相互作用 50 |
| （3）密度介在型と形質介在型の相対的な重要性 53 |
| 4 間接相互作用と進化 55 |
| （1）間接相互作用が生み出す共進化 55 |
| （2）間接相互作用が進化の方向を変える 58 |
| 5 今後の展望 60 |
| （1）個体の形質から生物多様性の維持創出機構を解明する 60 |
| （2）進化的な観点から生物群集を理解する 61 |
| （3）生物の適応が間接相互作用を通して生物群集を変える 62 |
| 第3章 生物群集を形作る進化の歴史（河田雅圭・千葉 聡） 65 |
| 1 群集構造と系統的・進化的な制約 66 |
| （1）進化プロセスと群集形成 66 |
| （2）群集の構成と系統関系 69 |
| （3）ニッチ形質の保守性（niche conservatism）とニッチの分化 72 |
| （4）系統関係とニッチ形質の進化はどのように群集に影響するか？ 77 |
| （5）種分化・絶滅・移動分散と種多様性 79 |
| （6）種分化率に影響する要因 82 |
| 2 大規模イベントの生物群集への影響 84 |
| （1）大量絶滅 85 |
| （2）絶滅の選択性 87 |
| （3）群集の復帰過程 95 |
| （4）現代における絶滅とその生物群集への影響 99 |
| 3 将来の研究への展望 109 |
| 第4章 多種系における表現型可塑性（西村欣也・岸田 治） 111 |
| 1 はじめに 112 |
| 2 食物網における捕食者―被食者の攻防 114 |
| （1）オタマジャクシの池 114 |
| （2）エゾサンショウウオ幼生の捕食危機に対処するオタマジャクシ 117 |
| （3）ヤゴの捕食危機に対処するオタマジャクシ 123 |
| （4）オタマジャクシの誘導防御形態の臨機応変性 125 |
| （5）エゾサンショウウオ幼生の誘導捕食形態 133 |
| （6）防御―攻撃の共進化 135 |
| （7）サンショウウオのジレンマ―攻撃か防御か？ 138 |
| 3 生態学における表現型可塑性研究の方向性 140 |
| （1）誘導防御形質の遺伝的基盤 140 |
| （2）エコゲノミクスの発展と可塑性研究 142 |
| （3）表現型可塑性の個体群動態・群集構造への波及 145 |
| （4）生物群集の中の表現型可塑性 147 |
| 第5章 共進化の地理的モザイクと生物群集（東樹宏和・曽田貞滋） 151 |
| 1 共進化の地理的変異 152 |
| （1）種レベルでの共進化と個体群レベルでの共進化 152 |
| （2）共進化の地理的モザイク仮説 153 |
| （3）ツバキとゾウムシの軍拡競走 154 |
| 2 自然淘汰の地理的モザイクとその形成要因 157 |
| （1）「遺伝子型×遺伝子型×環境」の相互作用 157 |
| （2）軍拡競走の生産性勾配―細菌と溶菌性ファージの実験 159 |
| （3）軍拡競走の生産性勾配―ツバキとシギゾウムシの野外研究 160 |
| 3 適応進化と群集構造 161 |
| （1）群集の種構成が適応進化を左右する 161 |
| （2）適応進化から群集構造へのフィードバック 165 |
| 4 移動分散とメタ群集レベルでみた共進化 168 |
| （1）遺伝子流動や遺伝的浮動と局所適応 168 |
| （2）移動・分散能力が異なる種で構成されるメタ群集 171 |
| （3）遺伝子流動が共進化を加速する 172 |
| 5 地理的モザイクの視点による異分野の統合 174 |
| （1）群集生態学・進化生物学・遺伝学における空間構造の解明 174 |
| （2）群集生態学と共進化研究の共同―拡散共進化への展開 177 |
| （3）群集生態学への分子遺伝学的手法の導入（群集遺伝学） 179 |
| （4）共進化研究と遺伝学の融合（共進化遺伝学） 180 |
| 6 さいごに 182 |
| 第6章 生物群集の進化―系統学的アプローチ（市野隆雄） 185 |
| 1 はじめに 186 |
| 2 系統レベルではたらく進化のプロセス 190 |
| （1）系統進化と小進化 190 |
| （2）系統淘汰と自然淘汰 193 |
| （3）なぜ系統淘汰が重要か？ 197 |
| 3 系統淘汰を検出するための手法―姉妹群比較法 198 |
| 4 群集の進化的遷移 202 |
| （1）ダーウィンの分岐の原理 203 |
| （2）群集の進化的遷移とは何か？ 205 |
| （3）群集の進化的遷移の証拠 206 |
| （4）進化的遷移の方向―姉妹群比較からの示唆 208 |
| （5）どのような群集でどのような種間関係が進化するか？―熱帯における相利関係の進化 209 |
| 5 群集が多様化していくプロセスの解明に向けて 213 |
| （1）種間系統樹からの研究方向 217 |
| （2）種内の分子地理系統樹からの研究方向―共進化の影響 218 |
| コラム1 生態ゲノミクス―適応・群集研究への新たなアプローチ（清水健太郎・竹内やよい） 223 |
| 1 はじめに 234 |
| 2 ゲノミクスと分子遺伝学の手法 225 |
| （1）QTLマッピング（量的形質遺伝子座マッピング，Quantitative Trait Locus Mapping） 225 |
| （2）ポジショナルクローニング 226 |
| （3）連鎖不平衡マッピング 226 |
| （4）トランスジェニック技術（形質転換技術） 227 |
| （5）マイクロアレイ（DNAチップ）解析 227 |
| （6）次世代の塩基配列決定装置（次世代シークエンサー） 227 |
| 3 ゲノミクスを用いた自然淘汰の解析―シロイヌナズナの適応を例に 228 |
| （1）集団のDNA変異を用いた自然淘汰の検出法 228 |
| （2）シロイヌナズナを用いた統合的研究例 230 |
| 4 群集遺伝学―ポプラを例に 234 |
| （1）集団内の遺伝的多様性が群集に与える影響 235 |
| （2）生物・生態系と相互作用をもつ遺伝子の特定 235 |
| 5 群集ゲノミクス―群集構造と機能の把握 238 |
| 6 展望―ゲノミクスのインパクト 239 |
| コラム2 群集生態モデルと進化動態―資源分割理論を例に（佐々木 顕） 243 |
| 1 はじめに 244 |
| 2 連続ニッチ空間の競争方程式 246 |
| （1）侵入可能性 247 |
| （2）1種群集への侵入可能性と限界類似度 248 |
| （3）Adaptive Dynamics入門 249 |
| 3 資源競争による群集の構築とAdaptive Dynamics 251 |
| （1）進化的安定性 252 |
| （2）到達可能性と進化的安定性は違う 253 |
| （3）進化的分岐 254 |
| （4）離散原理 256 |
| （5）PIP 259 |
| （6）分断淘汰と生殖隔離による種分化 259 |
| 4 MacArthurの群集理論と最小原理 260 |
| 5 群集の進化の理論化にむけて 262 |
| 終 章 群集生態学と進化生物学の融合から見えてくるもの（吉田丈人・近藤倫生・大串隆之） 263 |
| 1 生物群集に対する適応の影響 264 |
| 2 適応に対する生物群集の影響 265 |
| 3 新たな課題 267 |
| （1）さまざまな相互作用への適応の影響 267 |
| （2）多種系の動態への適応の影響 267 |
| （3）系統的・生物地理的な制約と生態的・局所的な制約の相対的な重要性 268 |
| （4）多種系における適応 268 |
| （5）大進化をもたらした生物群集 269 |
| 4 あらためて適応とは？ 270 |
| （1）変異―適応をもたらす源 270 |
| （2）適応と不適応 272 |
| （3）広義の適応 272 |
| 5 おわりに 273 |
| 引用文献 275 |
| 索引 323 |
| 口絵 i |
| はじめに v |
| 第1章 適応による形質の変化が個体群と群集の動態に影響する（吉田丈人・近藤倫生） 1 |
図書
