| 序 稲田利文 |
| 序章 RNAの基礎知識 |
| 1 RNAの構造,機能と種類 稲田利文 10 |
| 【1】RNAの構造 |
| 【2】細胞内RNAの種類と機能 |
| 2 RNA研究の重要性 稲田利文 13 |
| 【1】RNA研究の流れ |
| 【2】RNA研究の今 |
| 【3】RNA研究の進展 |
| 3 RNA実験の超基本 稲田利文 15 |
| 【1】RNAを扱う際の注意点 |
| 【2】RNAを扱うための実験環境 |
| 【3】実験器具と試薬の準備の仕方 |
| 第1章 RNAの取り扱い方 |
| 1 抽出 17 |
| ①大腸菌からのRNA抽出 宮内健常 鈴木 勉 17 |
| ②酵母からのRNAの抽出 稲田利文 21 |
| ③線虫C.elegansからのRNA抽出 高崎輝恒 笹野有美 坂本 博 24 |
| ④ゼブラフィッシュ胚からのRNA抽出 三嶋 雄一郎 井上邦夫 29 |
| ⑤ショウジョウバエからのRNAの抽出 石塚 明 稲垣 幸 塩見春彦 33 |
| ⑥培養栽培からのRNA抽出 星野真一 細田 直 39 |
| ⑦シロイヌナズナからのRNA抽出 尾之内 均 内藤 哲 42 |
| 2 分光光度計による定量 稲田利文 44 |
| 【1】RNAの紫外線吸収 |
| 【2】吸光度A260の測定（濃度測定） |
| 【3】吸光度A280の測定による純度の確認 |
| 【4】超微量測定 |
| 3 電気泳動 吉久 徹 47 |
| 【1】ホルムアルデヒト-アガロース電気泳動 |
| 【2】尿素-ポリアクリルアミド電気泳動（低分子RNA用） |
| 4 RIとnon-RIでのin vitro転写とラベリング 青木一真 廣瀬哲郎 54 |
| ①in vitro転写によるラベリングの原理 |
| ②RIによるラベリング |
| ③non-RIによる転写とラベリング |
| 第2章 RNAの解析 |
| 1 ノーザンブロット法 稲田利文 61 |
| 【1】サンプル調製 |
| 【2】RNAの変性ゲル電気泳動とメンブレンヘのトランスファー |
| 【3】ハイブリダイゼーションと検出 |
| 2 RT-PCRを用いたRNAの検出と定量 星野真一 船越祐司 66 |
| 【1】ゲノムDNA分析処理 |
| 【2】逆転写反応 |
| 【3】PCR反応 |
| 3 whole mount in situ hybridization 70 |
| ①ショウジョウバエ胚のwhole mount in situ hybridization 園部（野嶋）浩子 中村 輝 70 |
| ②マウス胚のwhole mount in situ hybridization 高橋 雄 83 |
| ③出芽酵母におけるFISH法 吉久 徹 89 |
| 4 RNA結合タンパク質の標的mRNAの分離 廣瀬哲郎 96 |
| 【1】RNA-タンパク質複合体の免疫沈降についての実験デザイン |
| 【2】エピト-プタグ付きタンパク質発現ベクターの作製 |
| 【3】トランスフエクション |
| 【4】RNA-タンパク質複合体の免疫沈降 |
| 【5】回収したRNAの解析 |
| 5 primer extension法によるRNAの5'末端の同定 湯川 泰 102 |
| 【1】プライマーの設計 |
| 【2】プライマーの標識（RI編） |
| 【3】プライマーの標識（non-RI編） |
| 【4】逆転写反応 |
| 【5】電気泳動 |
| 6 S1マッピングによるRNA末端の決定 田上英明 107 |
| 【1】DNAプローブの標識 |
| 【2】1本鎖標識DNAプローブの調製 |
| 【3】S1反応 |
| 7 RACEによる鋳型鎖の上流・下流配列の決定 佐々木保典 廣瀬哲郎 114 |
| 【1】RACE（rapid amplification of cDNA ends）法 |
| 【2】RACE法の実験デザイン |
| 【3】RACE法の概略 |
| 【4】5'RACE（RLM-RACE） |
| 【5】3'RACE |
| 8 ポリソーム解析 稲田利文 121 |
| 【1】細胞粗抽出液の調製 |
| 【2】スクロース密度勾配遠心による分画 |
| 【3】RNAの回収 |
| 第3章 RNAを用いた応用解析 |
| 1 mRNAからのタンパク質翻訳反応 125 |
| ①鋳型mRNAの調製 今高寛晃 125 |
| ②大腸菌由来酵素，因子群を用いた翻訳 清水義宏 上田卓也 128 |
| ③酵母を用いた翻訳 西川周一 131 |
| ④コムギ胚芽抽出液を用いた翻訳 高井和幸 澤崎達也 遠藤弥重太 138 |
| ⑤哺乳動物細胞を用いた翻訳 今高寛晃 142 |
| 2 in vitroスプライシング反応 井手上 賢 廣瀬哲郎 148 |
| 【1】HeLa細胞核抽出液の調整 |
| 【2】in vitroスプライシング反応 |
| 3 アフリカツメガエル卵母細胞を用いたRNA核外輸送の解析 福家浩之 大野陸人 154 |
| 【1】アフリカツメガエルからの卵母細胞の摘出 |
| 【2】微量注入サンプルの作製 |
| 【3】卵母細胞への微量注入 |
| 【4】核と細胞質の分離 |
| 【5】RNAの抽出・精製 |
| 4 SELEX法によるRNAアプタマーの取得 大内将司 160 |
| 【1】RNAプールの作製 |
| 【2】アフィニティ選別 |
| 【3】逆転写PCR |
| 【4】2ラウンド目以降 |
| 5 RNA高次構造の解析とデータベースの利用 濡木 理 167 |
| ①T7 RNAポリメラーゼによるRNAのin vitro転写 167 |
| ②RNAの結晶化 171 |
| ③RNA結晶のX線結晶構造解析 175 |
| ④データベースの利用 176 |
| 6 質量分析法を用いたRNA修飾ヌクレオシドの解析 鈴木健夫 鈴木 勉 177 |
| 索引 182 |
| 下巻索引 186 |
